1958年北医三院建院初期，隶属于外科教研室的麻醉专业组是今天北京大学第三医院麻醉科的前身。从1958年到1969年，北医三院最早的一批麻醉医师们在艰苦的条件下，开始了为外科手术保驾护航的临床麻醉工作。同一时期，还开展了针刺麻醉的临床研究，吸引了来自国外的临床医师和包括西哈努克亲王和尼克松女儿等一批国际政要来三院参观。
　　20世纪70年代以后，伴随着北医三院临床医疗的快速发展，麻醉专业组在麻醉技术、人员素质、仪器设备等各方面不断得到加强和提高，1987年北医三院麻醉科正式独立建科，成为国家临床二级学科。此后的二十多年来，北医三院麻醉科几代人风雨兼程，励精图治，到今天，她已经成长为在国内具有一定影响地位的，集医疗、教学和科研于一体的现代化专业科室。全科现有医护人员51名，其中教授2名，主任医师4名，副教授3名，副主任医师12名，主治医师23名。在硬件方面，麻醉科拥有各种先进的麻醉机、监护仪、血气分析仪、微量输液泵、纤维支气管镜和可视喉罩等麻醉专用设备和仪器。在临床工作方面，麻醉科主治医生以上的高年资医师都具备丰富的临床经验，以及对各种疑难危重病人的麻醉管理、抢救复苏能力，辅以先进的专业仪器和设备，为手术安全提供了强有力的保障；目前麻醉科核心领导小组正在亚专业水平，有目的地培养一批专业理论精通、技术精湛的麻醉学专家。在教学方面，麻醉科承担着北京大学医学部本科及八年长学制学生教学任务，多次在本科生长学制教学工作检查中获得好的成绩；同时麻醉科还是国内数所医学院校的临床见习、实习基地；近年来，麻醉科还积极开展了与美国哈佛大学医学院、英国帝国大学医学院以及美国斯坦福大学医学院，美国华盛顿大学医学院的交流与学习。在科研方面，2008年麻醉科荣获两项自然科学青年项目基金，与临床密切相关的科研课题已经启动。在科室管理方面，麻醉科核心领导小组注重科学化、弹性化、人性化、信息化管理模式，充分发挥全科室人员的积极性和创造力，与外科同仁一起，创下了全国平均住院日最短的佳绩！
　　北京大学第三医院外科正在蓬勃发展，如何构建国际先进的现代化的麻醉手术平台，已经成为当前北京大学第三医院的工作重心，乘着这股东风，麻醉科核心领导小组正在以科学发展观做为科室进步的精神武器，抓住机遇，迎接挑战。让我们共同祝愿：北京大学第三医院麻醉科将与整个北京大学第三医院一起，腾飞在二十一世纪！