中医科现有正式人员编制1l人，其中主任医师3人，副主任医师6人，主治医师5人，住院医师1人，医师助理2人，另有3名退休返聘专家具有博士学位的有7人，硕士学位的有3人目前日门诊量400-500人次，年门诊量超过10万人次，居全院各科室前三位，在北京市综合医院中医科中也名列前茅2011年中医科被批准成为北京地区综合医院示范中医科建设单位。
　　在中药治疗不孕症、消化、呼吸、甲亢、心脑血管疾病、风湿病、乳腺病、皮肤病、颈腰椎病、运动损伤、痛证、中风后遗症等领域形成特色，并设立诊疗专台。
　　科室医师积极到基层进行中医药防病、保健方面的健康教育，每年举力、多次健康咨询和义诊活动201。年共有10余人次到基层开展中医诊疗服务，义务诊治患者600余人次。
　　2007年以来，科室深化8年制医学生的中医教学改革，建立起中医多维式教学模式和多站式考试模式加强了医学生对中医药理论的理解和兴趣，促进了中西医结合人才的培养。
　　中医科拥有较强的对外教学实力，已有来自美国、德国、日本、西班牙、巴西等许多国家的进修生、留学生数800余人次在中医科接受过培训。1997年起与西班牙塞维亚黄帝针灸协会建立合作，定期举办交流活动至今已办了9届。
　　近年来中医科医师负责国家级项目(《基于生物信息学和代谢组学的慢性萎缩性胃炎寒热证的标记物网络研究》)一项，参与并负责973课题子课题一项，负责首都科学发展基金项目一项，首都重大疾病规范化诊疗课题一项，院级课题7项近三年来发表SCI论文5篇，在核心期刊发表论文40余篇。
　　中医科是个团结、奋进、力求创新发展的集体，是有着良好医德医风传统的科室将尽一切可能为广大患者提供优质的服务。
　　专业组建设
　　中医门诊在全面完成常见病种基础上，创立5-6个优势病种，重点发展以下几个专科：
　　1.中医中药介入辅助生殖技术：北京大学第三医院辅助生殖技术全国领先，中医针灸在调节内分泌方面有确切效果，在辅助生殖前后介入，对提高试管婴儿成功率有益，在这方面配合生殖中心，形成新的创新点，并逐渐形成自己的医疗和科研小团队，提高辅助生殖知名度的同时，逐步涉及不孕不育全领域，争取形成不育不孕治疗专项优势项目。
　　2.中医辨证治疗慢性萎缩性胃炎：对慢性萎缩性胃炎的治疗中医药可以发挥自己独特的优势，可以借助北京大学第三医院消化科的先进的检查手段来评价中医中药的疗效。
　　3.中医中药在治疗皮肤病：目前西医皮科专家也使用中草药来保证临床疗效。这就提示我们经过专门而系统的中医辨证和辨病相结合，应该能取得比他们西医单纯辨病使用中药更好的临床效果。
　　4.中药针灸综合治疗颈肩腰腿痛：临床证实针灸、推拿、穴位贴敷、中药熏洗、刺血、穴位注射、牵引、内服中药、针刀等单一疗法对于各种骨伤和运动系统疾病有确切疗效，中医科可以依托北京大学第三医院骨科和运动医学优势，发展综合上述单一疗法治疗无需手术的颈肩腰腿痛如腰椎间盘突出、颈椎病、关节炎、肩周炎、网球肘、运动损伤等，形成专项治疗小组，如条件允许，争取成立颈肩腰腿痛保守治疗中心，形成特色。