北京肺结核医院病理科是医院最早成立的研究和诊断科室之一。主要承担医院的医疗、教学及科研工作。

　　截止到2005年1月，北京肺结核医院病理科完成临床各种病理活检诊断46000余例（各型肺癌6000余例），肿瘤脱落细胞学病理检查246000余人次，肺癌痰细胞学阳性率达到60~70%，大部分肺癌患者术前得到明确诊断，且分型准确。在诊断及鉴别诊断中，开展了组织化学、免疫组织化学、电子显微镜等辅助诊断方法，使病理诊?的准确性达到新的水平。尤其手术中快速冰冻诊断在20~30分钟内做出明确诊断，冰冻和石蜡切片诊断符合率处于较高水平。

　　北京肺结核医院病理科在科研和教学工作中，共获得市级及局级科技成果奖10项，公开发表论文40余篇，培养病理专业研究生5名，协助其它科室培养研究生7名。