北京京都儿童医院血液肿瘤中心由国内儿童血液病领域知名专家、国务院特出贡献专家吴敏媛教授，北京京都儿童医院副院长孙媛教授引领的京都儿童医院专家团队组成，开展包括各种类型贫血、出血性疾病以及儿童血液系统恶性肿瘤、先天性免疫缺陷病等儿童血液系统良、恶性疾病诊疗项目。设立3个普通血液科以及2个干细胞治疗科、血液实验诊断室、细胞分离室、血液肿瘤门诊、PICC门诊等10个功能区，拥有固定床位近200张，其中百级洁净仓19个。此外，血液肿瘤中心成立了噬血细胞综合征及慢性活动性EB病毒患儿救助基金――血脉相连救助基金，专为0-18岁患有噬血细胞综合征及慢性活动性EB病毒的困难患儿家庭进行援助。 北京京都儿童医院血液肿瘤中心实验室及免疫治疗实验室即将完成整体建设，届时，血液肿瘤中心将实现各类细胞免疫治疗和基因治疗等先进的技术，实现血液病的精准诊断及分层，更积极、更精准的治疗，为患儿提供全面、完善的生命保障。