急诊建科之前，北京协和医院还没有独立的“急诊科”，只有行政上有一定独立的“急诊室”，其临床工作主要是医院从住院部各专科轮流抽调医生来急诊值班，负责接诊、留观、收治急诊的各种病人，没有专门的急诊医生，其中邵孝鉷大夫在急诊室值班时间最长。1983年，北京协和医院新任院长陈敏章指示设立独立的急诊科，这是中国正式建立的第一个急诊科，并任命邵孝鉷为第一任急诊科主任。1985年，北京协和医院急诊科成为了中国急诊医学第一批临床硕士培训点之一，并于2003年再次成为了中国第一批急诊医学博士培训点之一;现任科主任于学忠、王仲教授即是中国首批毕业的急诊医学硕士生。1987年在北京协和医院等单位发起下组建成立了中华医学会急诊医学会，邵孝鉷当选为为第一任急诊医学会主任委员并于1991年再次当选为第二任主任委员。1992年，邵卸去科主任职，由周玉淑教授接任，1997年由马遂教授接任科主任，2005年于学忠教授接任科主任至今。

截至2011年，协和医院急诊科共有留观抢救床位140余张，急诊专科医护人员200余人，平时急诊工作量约400人/日，周末或节假日工作量500人/日;年均抢救患者3000余例，年均行气管插管、机械通气患者400余例。现有教授4人、副教授2人(其中博士研究生导师3人、硕士研究生导师2人)、主治医生14人，主治以上医生100%具有欧美等发达国家学习经历。年培养研究生4-6人，每年招收急诊住院医生3人、急诊专科住院医生基地培训生10人、进修医生20人左右。2002年起承担协和医科大学8年制本科生急诊医学教学，2004年起承担北京市急诊住院医师培训，2005年成立了北京市第一个急诊住院医师培训基地。主编本科生和研究生统编教材«急救护理学»、《急诊医学》等。自2007年起，急诊科开始组织主办每年一届的“北京协和急诊医学国际高峰论坛”，2011年为第五届，会议注册人数2500人左右，影响力为全国急诊医学会议之最。

北京协和医院急诊科作为中国第一个急诊科，已经建立了完善的急诊流水区、急诊抢救室、急诊留观区、急诊病房、急诊ICU全套体系，在医疗技术、急诊教育、学术水平和影响力等方面均居国内领先地位。 2011年底，在建的新急诊大楼马上将投入使用，届时急诊科规模将扩充一倍以上，必将为来自全国各地的患者提供更好的服务。