北京协和医院外科在老一辈外科学家曾宪九教授、吴蔚然教授和钟守先教授等的领导和努力下，早在上个世纪的50年代就开展了肝脏手术，是国内开展肝脏切除手术最早的医院之一，之后在北京协和医院基本外科的基础上从肝脏专业组发展到肝脏外科中心，一直到目前独立的肝脏外科，经历了半个世纪的成长过程，至今终于发展壮大。

现任科主任为卫生部副部长黄洁夫教授兼任。黄部长为国际、国内著名的肝脏外科专家，是公认的九十年代中期国内第二次肝移植高潮的推动者和学术带头人。他是成立不久的中国器官移植委员会(OTC)的主任委员、中华医学会副会长，同时是美国肝脏移植协会终身会员，哈佛大学、斯坦福大学和麻省理工学院等的客座教授。他多年来致力于肝脏移植和肝胆恶性肿瘤的外科学研究，并达到很深的学术造诣，擅长肝脏高难度手术及疑难重症的诊治。黄洁夫教授先后获得6项省、部厅级以上科研成果，主编外科学专著11部，参加编写外科学专著5部。先后在国内外有影响的杂志上发表论文160多篇。他还担任《中华医学杂志》、《中华外科杂志》、《中华普通外科杂志》、《中华肝胆外科杂志》等国内外十多种杂志的主编、副主编和编委。

北京协和医院肝脏外科的首席专家为钟守先教授，钟教授是国内外科界德高望重的前辈，在近半个世纪的外科生涯中，他创造了许许多多外科奇迹，在业内同行中传为美谈。钟教授早年毕业于前苏联哈尔科夫医学院，其后又在美国哈佛大学麻省总医院和约翰-霍普金斯医院外科学习。多年来他一直在临床第一线工作，有坚实而广泛的理论基础和丰富的临床经验，手术技术清湛，善于解决腹部外科的各种疑难杂症及术后的各种严重并发症的处理，他在肝胆胰外科上有很深的造诣，尤其对我国胰腺、肝脏外科的发展作出了很大的贡献，70年代末在曾宪九主任的亲自关心下他在协和医院创建了国内首个胰腺外科。钟教授多年以来一直是国际外科学会中国会员代表。在他的直接领导下开展了协和医院首例肝移植术手术。他担任《中华外科杂志》和《中华普通外科杂志》等中外十余种外科专业杂志的编委、常务编委、副主编、顾问等职。参与编写《黄家驷外科学》、《现代胃肠病学》、《临床胰腺病学》、《外科临床指导》、《腹部急诊学》等近20种外科专著，并主编了《胰腺外科》及《胰腺外科学》。现为中央保健组成员，享受国家特殊津贴。

北京协和医院肝脏外科现有博士生导师2名，硕士生导师3名，正副教授5位，主治医师5位，所有成员均有博士学位。多名科室成员担任《中华外科杂志》、《中华普通外科杂志》、《中国实用外科杂志》、《中华肝胆外科》、《中国医学科学院学报》、《中国临床营养杂志》等杂志主编、副主编和编委。本科目前拥有 28张病床，位于北京协和医院东院区，年收治病人1000余人，手术近500台，其中肝脏手术约400台。开展的治疗项目包括：肝脏良恶性疾病的诊断和治疗，包括手术、化疗、介入治疗、生物治疗等在内的综合治疗;肝脏移植;腹部疑难杂症及其它相关疾病的诊治等。凭借我院强大的综合诊治实力，我科的各种肝脏手术的并发症保持在2%以下;同时成功的诊治了各种肝脏的疑难杂症，包括世界首例的肝脏原发上皮-肌上皮癌病例。北京协和医院肝脏外科还充分利用医学科学院和基础研究所资源，开展了分子生物实验、细胞培养、免疫组化、病理、组织标本库和图书资料室等工作，每年承担多项临床与基础方面的研究课题。近年来，多篇文章在国内外各种杂志上发表，并获得各种医疗奖项。

2006年6月北京协和医院肝脏外科荣获美国中华医学基金会(China Medical Board in New York, CMB)一百万美元的基金资助，用于协助设立国内的相关法制法规的建设，协助建立移植标准和登记制度，同时加强专业人员的培训，广泛同各个医院合作，扩大肝移植肝癌相关的研究成果。此基金的获得还有助于增进国际间的合作和交流，及时获得国际上相关专业的最新进展和成果。该项目以中国医学科学院北京协和医院为主体，由中山大学第一附属医院和天津第一中心医院共同承担完成，卫生部副部长黄洁夫教授为该项目的领头人。此外,肝脏外科目前还担负数项国家自然科学基金项目,并和美国、加拿大等国共同合作研究相关项目。

北京协和医院肝脏外科每年均正常招收一定数量进修医师，对他们进行理论和实践的培训。同时也负责协和医学院八年制的教学、培养，以及研究生的培养。