北京大学第一医院风湿免疫科成立于2007年6月，张卓莉教授任科主任。截止到2010年6月份，科室共有医护人员20名。现病房开放27张病床。主要诊治类风湿关节炎 系统性红斑狼疮 结缔组织病相关的肺动脉高压、干燥综合征 系统性硬化症 多发性肌炎 皮肌炎 强直性脊柱炎 牛皮癣关节炎、骨关节炎 白塞病以及其他类型的系统性血管炎等各种风湿免疫性疾病，特别擅长各种类型关节炎，尤其是类风湿关节炎的诊断和治疗。

北京大学第一医院风湿免疫科有独立的实验室和迷你关节镜检查室，在国内率先开展了迷你关节镜和滑膜活检检查，为各种疑难关节病的诊断和治疗提供了依据。在结缔组织病相关肺动脉高压的诊断和治疗方面有丰富经验，是我国诊治肺动脉高压的北方基地之一。

北京大学第一医院风湿免疫科的成立可以追溯到2006年，北京大学第一医院大内科丁文惠主任、郭晓慧主任、李海潮主任拜访北京协和医院风湿免疫科张奉春主任，几位主任介绍了北京大学第一医院酝酿成立风湿免疫科的设想，并希望张奉春主任能够给予帮助。 经过多方推荐及刘玉村院长的大力支持，张卓莉大夫于2007年5月应邀由北京协和医院风湿免疫科调入北京大学第一医院。至此，北京大学第一医院风湿免疫科进入筹备阶段。 2007年5月，张卓莉大夫在北京大学第一医院开始出门诊。当时，风湿免疫科只有一名年轻的王昱大夫。

2007年6月张卓莉大夫赴荷兰阿姆斯特丹医学中心开始为期一年的工作。在荷兰的一年，张卓莉大夫对科室的发展进行了详细的规划，物色科室人才，确定科研方向，筹划建立关节检查中心，建立了风湿免疫科临床诊疗规范，为科室的建设和发展打下了基础。

2007年7月周炜大夫结束为期四年的国外生活，回国并加入北京大学第一医院风湿免疫科，开始出专科门诊并承担起院内外的会诊工作，至此北京大学第一医院风湿免疫科有了三名大夫。同年年底郝燕捷大夫也加入风湿免疫科。张卓莉大夫经与院方商量后，先后将王昱、郝燕捷大夫送到北京协和医院进行风湿免疫专科培训。 2008年5月张卓莉大夫回国，风湿免疫科进入正式运转阶段。当时在二部南楼一楼借了一间办公室，条件尽管简陋，但是四位年轻大夫对风湿免疫科的未来充满憧憬，在那里完成了很多科室的基础工作，许多今天看到的成果，都是当时在那间小屋孕育过，风湿免疫科从那间小屋开始鼓风扬帆，走向今朝。 2008年7月李光韬大夫肾内科毕业加入风湿免疫科，风湿免疫科已经能够做到天天有门诊。

2008年9月风湿免疫学科著名专家董怡教授和唐福林教授接受张卓莉大夫的邀请开始在北大医院风湿免疫科出门诊，他们两位老教授的加入给一个新生科室竖起坚强的后盾。他们的加盟对提高北大风湿免疫科的知名度、提携年轻大夫起到了重要作用。一时间，被风湿免疫科圈内所称羡。

2008年10月， 在大内科丁文惠、心内科霍勇两位主任支持下，心内科挤出十张病床支援风湿免疫科。风湿免疫科开始有了自己病房，缓解了部分就医难的问题。与此同时，科室开始了一系列院内外的宣传工作，定期举办患者教育课堂，与好大夫网站建立沟通渠道。科室大夫人人动手写关于风湿免疫专科的科普文章并在有关媒体发表。

2009年全年风湿免疫科举行了四次患者教育活动，张卓莉大夫在国内的讲学活动达到50场以上。风湿免疫科已经有7名医师，博士研究生6名，硕士研究生3名。病房呈现“一床难求”景象，月门诊病人数突破1300，并继续呈稳步增长趋势。

2008年度全科共撰写11份课题标书，参与三项“十一五”课题，郝燕捷大夫获得北大青年研究基金。