我院男科是目前北京地区门诊量最大的的男科诊疗中心，也是全国最知名的男科诊疗基地之一，在全国的男科学术界具有重要的影响力。随着近几年的努力和发展，我院男科诊疗范畴基本涵盖了目前男科的所有相关疾病，包括男性不育症、男性性功能障碍、急慢性前列腺炎、男性雄激素缺乏综合症、男生殖器畸形矫正以及其它与男性生殖系统相关的疾病等。近几年来还陆续开展了针对输精管梗阻的显微外科复通手术、男生殖器显微外科矫正手术、射精管梗阻电切术、精索静脉曲张显微外科结扎术等先进技术，在国内居领先地位。

我院男科设置先进，包括男科专家门诊、男科特需专家门诊，并建有男科检查室、男科实验室、男科手术室和男科疾病手术病床等。特别是在男性不育症方面拥有先进的实验室设备，能开展多项与男性生育能力相关的检测和治疗。

我院男科现有5名医生(均有博士学历)，其中教授1名副教授1名，技术员4名，护士2名，在读研究生5名。近五年来共发表学术论著30余篇，其中SCI论著2篇，核心期刊论著21 篇;主编或参与编辑出版专著12部，共培养毕业研究生4名，发表科普类文章200篇以上。近五年来男科的重点科学研究方向在“男性不育和男性生殖健康相关的临床与基础研究”，先后获得过五项科研和临床药物研究基金，总经费近百万元，研究水平居国内先进。我院男科还是卫生部生殖医学的专科医师培训中心，为全国各地的医疗机构培养了几十名男科进修医师，带动了我国男科学水平的发展。