儿童口腔科始建于1951年，是医疗、教学、科研全面发展的儿童口腔医学专业科室，综合水平位于全国前列，开创国内多个“首个”。我国首个儿童口腔医学二级学科（2002年起）；首个儿童口腔医学国家级继续教育基地（2004年起）；2007年成为我国首个、目前也是唯一的儿童口腔医学博士学位授权学科点。中华口腔医学会儿童口腔医学专业委员会主任委员单位；全国高校统编教材《儿童口腔医学》主编单位；《儿童口腔医学》国家级精品课程单位。目前有10个诊室，27台综合治疗台，独立的技工室和日间全麻诊室，是我国配置最完善、规模最大、技术力量最强的儿童口腔医学专业科室。诊疗对象为18岁以下儿童，日均门诊量250人左右，完成大量来自全国各地儿童口腔科疑难病例，并对外省市单位提供远程会诊。
　　北京大学口腔医院儿童口腔科始终跟踪国际先进水平，所用诊疗标准和技术手段与国际先进水平同步。日常主要诊疗内容有：儿童龋病综合防治；儿童牙髓病根尖周病诊治；无痛微创治疗技术；儿童牙外伤诊治；儿童牙齿发育异常诊治；儿童咬合异常早期干预及咀嚼生长发育；残障儿童口腔疾患诊治；儿童遗传病和系统病在口腔中表现的诊治和相关研究等。
　　同时，注重临床新技术的开发，拥有一批特色技术，如：低龄儿童重度龋标准化诊疗模式及治疗前后评估系统、微创龋齿治疗技术体系（激光技术、预防性树脂充填技术、间接牙髓治疗术等）、年轻恒牙牙髓血运重建术、特殊儿童的牙科治疗（儿童先天无牙合的治疗、遗传学疾病和严重全身系统病儿童的牙齿治疗等）、儿童咬合诱导、儿童髁突骨折的保守治疗和前牙外伤断冠粘接技术等。1999年开展了我国首例全身麻醉及镇静下儿童牙齿治疗，是国内首家获得‘医疗技术准入’开展全麻、口服、静脉和吸入麻醉下儿童牙齿疾病治疗的医疗单位。
　　儿童龋病
　　目前我国儿童龋坏率高，治疗率低，龋病进一步发展会导致牙髓和根尖周病变。在我国儿童龋病一直是儿童口腔科的主要工作，超过90%的工作都是围绕龋病展开的。但儿童配合度差，影响疗效的因素多，治疗难度大；另一方面，新发龋（包括继发龋和再发龋）是龋齿治疗失败的主要原因，不断出现的新发龋导致了治疗→复发→再治疗的循环，是治疗远期失败的重要原因。我科有一套‘龋病的综合治疗’解决方案，包括术前全面评估、标准化治疗方案、术后监控与预后评估等在内的规范化治疗模式，努力降低儿童龋病的治疗风险，减少再患龋危险性，杜绝或减少新发龋的发生。在低龄儿童（特别是3-4岁以下）重度龋方面取得一定成果。
围绕龋病的治疗开展了一系列的新技术和疗法，如：预成冠修复技术，间接牙髓治疗，预防性树脂充填技术，恒牙邻面龋的早期发现与诊断，窝沟封闭技术药物防龋技术等。
　　全身麻醉和镇静下儿童牙齿疾病的治疗
　　全身麻醉和镇静下儿童牙齿治疗是一项针对目前在口腔医学临床工作中难于对牙科恐惧症患儿、3岁以下低龄儿童及智障儿童实施常规口腔诊疗的特色技术项目。从1999年开始，北京大学口腔医院儿童口腔科和麻醉科相互协作在国内率先开展了在全身麻醉及镇静条件下进行牙齿治疗。十余年来，以葛立宏教授为首的治疗小组建设了拥有先进设备的全麻治疗室，积累了丰富的经验，使该技术成为北大口腔医院特色医疗技术之一。该治疗技术优点是在一次治疗中完成全口所有需进行的治疗工作，适用于配合能力差，治疗需要量大的患儿。
　　有该治疗需要的患者在经儿童口腔科医生检查后请进行预约登记，并在主治医生的协助下帮助孩子树立良好的口腔卫生习惯。全身麻醉下牙齿治疗须知：
　　1. 目前的研究表明：全身麻醉下进行牙齿治疗不会对患者的身心造成不利影响。
　　2. 全身麻醉下对牙齿治疗的方法与常规条件下治疗的方法没有差异，对那些牙体硬组织缺损大，根尖病变严重的患牙并不会因在全麻下治疗而显著改善疗效。
　　3. 全身麻醉下的牙齿治疗是对已经出现龋坏，牙髓根尖病变的牙齿进行治疗，治疗本身并没有预防再患龋的作用，而培养孩子良好的口腔卫生习惯才能起到防患于未然的作用，这需要家长在日常生活中与孩子一起努力。
　　4. 全身麻醉下牙齿治疗的费用包括：牙齿治疗费、术前检查和麻醉费用。各项费用均为自费。
　　5. 目前预约该院全身麻醉下牙齿治疗的患者很多，等候时间较长，在此期间患儿的病情会有加重，希望家长按医生要求定期就诊，有效改善孩子的口腔卫生状况，改正不良的口腔卫生习惯，以减缓牙齿继续病变的进程。
　　儿童错合畸形的早期干预
　　在儿童牙齿和颌面生长发育时期去除影响其正常发育的因素，能达到预防和减轻错合畸形的目的。如针对牙齿反合，牙齿不能正常萌出或萌出位置异常，牙齿间存在间隙，牙齿先天缺失，以及存在口腔不良习惯等问题进行早期诊断和矫治。儿童口腔科开展此专业已有三十余年的历史，拥有一个独立的国内最早成立的技工室。
　　儿童牙齿外伤
　　儿童口腔科注重儿童牙齿外伤的研究。经过李宏毅、张雪珍、葛立宏、秦满、陈洁、郑树国等数代人的努力，北京大学口腔医院儿童口腔科在儿童前牙外伤的医教研等各方面均在国内处于领先地位。每年诊治大量的儿童前牙外伤患者，在诊断、治疗及预后判断方面具有丰富的临床经验。