牙周病科是集医疗、教学、科研三个职能为一体的专业诊室。在国家临床重点专科建设项目的评比中，荣获牙周病学专业的第一名。目前，拥有五名教授/主任医师，四名主任医师，七名副主任医师，三十名医师中93%具有博士学位，聚集了一批全国知名的牙周病学专家。十四名洁治员，三名具有医师资格。三十二名护士，主管护师三名，护师十四名。全科有34个综合治疗台, 每天接诊海内外患者近三百人，同时承担中央首长的牙周保健工作。牙周病科是牙周病学专业最早的博士点单位，全国统编教材《牙周病学》主编单位，全国牙周继续教育培训基地，国家药监局药物临床研究基地。承担多项国家科研课题，在国际上发表论文约60 篇。
　　北京大学口腔医院牙周病科日常开展规范和高质量的牙周基础治疗,同时注重多学科的综合治疗(如牙髓治疗、正畸、修复、关节)和手术治疗相结合, 重视患者的长期随访，结合多样化的健康促进以及维护治疗，以获得长期而稳定的疗效。八十年代开始的“牙周炎疗效及活动期的监测”、九十年代开展的“引导性牙周组织再生”、膜龈手术、植骨术等具有代表性的重点技术项目为国内领先, 部分已达国际水平，现已开展牙周治疗、维护、种植、修复一体的种植技术，逐渐与国际种植工作的开展方式接轨。
　　牙周科对疑难病例具有较高的诊断水平。如Papillon-Lefevre综合征、口-面-指综合征及青春前期牙周炎的确诊均由该科率先在国内报道。对白血病、Corhn’s病、淋巴瘤、组织细胞增多症、低磷酸酶血症、甚至牙龈癌以及牙龈结核等全身疾病在牙周组织的表征、药物性牙龈增生、牙龈出血、浆细胞肉芽肿等疾病和状况都具有较强的诊断能力, 准确率达95%以上。