安徽省立友谊医院感染科地处南院区，病区相对独立，主要负责常见感染性疾病的诊疗，如病毒性肝炎，肝炎肝硬化，肺结核，伤寒，流感，麻疹，水痘，流行性腮腺炎，流行性脑脊髓膜炎，流行性乙型脑炎，感染性腹泻，疟疾等传染性疾病。拥有医护人员11人，全科医护人员都长期从事感染科工作，临床经验丰富。医生现5人，其中副主任医师2人，主治医师2人，住院医师1人。感染科平均年住院达600余人次。在遇有传染病暴发流行的时候，感染科为社会提供了一定的储备应急能力。在每年的5-10月份，承担省级医院的肠道门诊任务，同时负责铁路系统肺结核病人的初诊、治疗、转诊等工作。感染科在业务上与时俱进，熟悉国内外最新专业进展，并同步应用于临床。开展了聚乙二醇干扰素α-2a（派罗欣）用于治疗病毒性肝炎的临床工作，取得了较好的治疗效果。按照核苷类似物抗乙肝病毒路线图对拉米夫定抗乙肝病毒效果进行疗效观察，优化了拉米夫定治疗方案，减少耐药发生。感染科作为三级医院必备临床科室之一，得到医院领导的重视，正积蓄力量求发展，力争与医院发展同步，做大做强，达到省内先进水平。