安徽医科大学附属巢湖医院儿科现有编制床位74张，其中普儿科44张，新生儿科30张。科室拥有各级医护人员57人，其中主任医师3人，副主任医师5人。科室设有普通门诊、专家门诊、儿童哮喘门诊和儿童保健门诊。
　　儿童哮喘门诊设有哮喘的规范化治疗与管理，雾化吸入，肺功能测定，过敏原测定及脱敏治疗。儿童保健门诊设有免疫接种、智力测定、生长发育、健康检查、儿童心理行为障碍、儿童多动症、睡眠障碍等咨询。
　　儿科病区设普通病房和PICU、新生儿病房和NICU，配有小儿有创、无创呼吸机、心电监护仪、小儿肺功能仪、新生儿暖箱、蓝光箱、辐射台、微泵等一批先进设备。科室在哮喘的诊治、新生儿窒息的复苏、新生儿呼吸窘迫综合症的治疗、脑瘫的干预及康复等方面均具有一定的专业优势。