亚健康是国际上提出的新概念，卫生部多次呼吁在中国大中城市建立这方面的业务，以健全目前的医疗保健系统。医院领导按照学科的调整安排将原来的妇幼保健中心与卫防科整合为西安交通大学第一医院亚健康中心，在原有职能不变的同时，进一步开展工作，做到资源共享，优势互补。
　　其职能定位如下：
　　1.人群健康促进：健康查体及亚健康诊断。
　　2.全院职工的医疗工作。
　　3.医疗窗口：保持原有的妇女保健、儿童保健、更年期保健、优生遗传门诊及妇幼实验室、妇幼B超工作，进一步开展亚健康诊断门诊。
　　4.受市上领导承担8个社区的妇女儿童的预防保健监测、统计及系统管理工作，以及全市妇幼保健人员的业务培训指导。
　　5.接受省、市、区领导的卫生防疫管理工作、传染病的监测上报及放射卫生的管理和上报任务。
　　6.承担该院及8个社区的儿童预防免疫接种任务。
　　7.承担该院及社区的育龄妇女计划生育管理工作。
　　8.承办《国外医学妇幼保健分册》杂志工作。
　　9.承担卫生部西北区妇幼项目的监测指导任务。
　　特色诊疗项目
　　1.更年期保健门诊：主要针对中老年妇女的心理保健需求与相关疾病的诊断，做到规范化治疗。建立就诊者个人挡案，实施科学评估，以心理咨询与保健为主，辅助以个体化的治疗方案。填补了西北区域综合医院“更年期保健门诊”的空白。成立了“更年期妇女俱乐部”，定期开展健康教育活动。
　　 2.优生遗传门诊：由陕西省政府挂牌命名，负责该省的遗传性疾病监测及业务指导工作。为提高出生人口素质，现开展了婚前、孕前、孕期的优生咨询及遗传病筛查，特别对有异常孕产史和反复流产的妇女进行病因诊断与治疗。
　　3.儿童保健门诊：针对儿童的身心发育、营养状况的评价、心理行为的咨询，进行预防保健及相应的矫治。