眼科是按照21世纪的新标准，本着高起点、高标准的要求创建中西医结合专科。由中华眼科学会会员、江苏省中西医结合眼科委员、江苏省美容主诊医师、扬州白内障无障碍行动手术组成员；市科学进步奖获得者；曾在广州中山大学眼科中心、上海复旦大学附属眼耳鼻喉医院进修的陆骏麒副主任医师担任科主任。拥有专科医师8名，其中副主任医师1人，主治医师4人，医师3人，2名医师具备国家高级验光员资质，多名医师曾在温州医学院附属眼视光医院、上海新华医院、北京同仁医院进修小儿斜弱视、眼底疾病、眼表疾病治疗。
　　拥有多种常规检查、诊断和治疗设备，如AB超、综合验光仪、日本托普康电脑验光仪、佳能全自动非接触眼压计、压平眼压计、瑞士532眼底激光、视野计、德国蔡司造影机、德国海德堡光学相干断层扫描仪、冷冻仪等，能够协助医生完善眼科相关检查，准确迅速确定患者病情并作出及时治疗。
　　在手术方面，拥有瑞士莱卡显微镜、美国爱尔康玻切仪、傲帝冷超声乳化仪等先进手术设备，为患者良好的手术效果提供了保障。目前已全面开展白内障超声乳化人工晶体植入术，各类抗青光眼手术，眼部美容术，显微镜下网脱巩膜外环扎术，23G微创高速玻璃体切除、抗新生血管药物眼内注射、玻切术后悬吊式人工晶体植入、以及斜视纠正，眼外伤急救等手术。
　　该院眼科为上海交通大学附属新华医院眼科小儿眼病科研合作单位，为患者筛查先天性遗传性眼部疾病；开展多种方法治疗儿童屈光不正，如角膜塑形镜、中医耳穴、手术后巩膜加固等；斜弱视方面在本市率先运用贴膜法治疗斜弱视，弱视治疗仪治疗弱视，完成多例复杂垂直肌手术。运用间接眼底镜筛查早产儿视网膜病变获得常熟市新技术引进进步奖。
　　开展眼部整形美容手术，主要包括各种重睑术（双眼皮成型手术）、眼睑松弛矫正术、眼袋手术、上睑下垂矫正术、睑裂开大术、眉下垂矫正术、眼窝狭窄矫正术、羟基磷灰石活动义眼台植入和安义眼片术、眼睑缺损修复术等。目前，已有上千例患者通过专科的治疗获得满意效果。
　　眼外伤方面和上海复旦大学附属眼耳鼻喉科眼眶、泪道、眼睑疾病专家深度合作，在本市率先开展medpor植片眼眶骨折植入，颌面外伤眼眶外伤联合手术、泪道断裂泪道引流管植入，各种复杂眼睑外伤、眼眶肿瘤手术。
　　玻璃体视网膜疾病方面本专业主诊医师自2003年起多次接受德国蔡司玻璃体视网膜高级培训班训练和学习，与北京大学人民医院、上海复旦大学附属眼耳鼻喉科医院、上海第一人民医院等国内一流眼底病专家保持密切联系，独立开展复杂性视网膜脱离、糖尿病视网膜病变、玻璃体黄斑界面疾病多种眼底疾病的手术治疗。熟练运用四代OCT、高速微创玻切、抗新生血管药物诊断治疗眼底疾患。
　　光明人生、人生光明、敬人至诚、敬业至精是中医院眼科人的座右铭。中医院眼科医务人员将竭尽所能为本地区的眼病患者提供帮助。科室拥有全套检查和治疗设备，如瑞士莱卡眼科手术显微镜、傲帝超声乳化仪、超声生物显微镜、压平眼压计、综合验光仪、眼压计、眼底激光、视野计、爱尔康玻璃体切割仪等，满足各种眼科疾病的诊断和治疗。科室常规开展白内障超声乳化人工晶体植入术，各类抗青光眼手术，羊膜移植手术，玻璃体视网膜手术，以及眼部美容,斜视纠正，眼外伤急救等眼科手术，以及医学验光配镜。在本地区，首先运用超声生物显微镜，开展眼科疾病的诊断，在小儿眼病、眼外伤治疗方面具有特色，成为上海交通大学附属新华医院小儿眼病科研合作单位，还通过互联网与多家国内一流眼科医院，在小儿眼科、眼外伤、眼眶骨折、玻璃体视网膜疾病和眼部肿瘤等疑难疾病方面为患者提供远程会诊。曾获市科技进步奖三次。