北京大学第三医院口腔科为集医疗、科研和教学为一体，口腔外科、牙体牙髓、牙周、粘膜、口腔修复、口腔正畸、儿科各亚专业齐备，人才梯队完整的现代化科室。目前共拥有90多名医护人员，其中医生近50名，包括高级职称医生13名，中级职称医生15名。
　　科室总设置牙椅49台，目前在北医三院本部院区设置有42把牙科综合治疗台，并配备先进的牙科锥形束CT、数字化牙片机及数字化曲面断层机、根管显微镜、内窥镜、完备而先进的消毒室设备，国内领先的科室信息化管理系统等，这些先进的设备不仅保证了医疗质量的提高，同时也为我们的进一步发展提供了强有力的支持。
　　承秉北医“勤奋、严谨、求实、创新”的传统，以及北医三院“病人至上”的服务宗旨，我们密切跟踪国内外口腔科学的最新进展，不断引进新技术，提高治疗水平，采用与北大口腔医院相同的“质量控制标准”对医疗质量进行严格的控制，并严格按照北京市卫生局颁布的收费标准进行公开而且规范的收费，为患者提供高水平的医疗服务。目前口腔各亚专业的治疗项目均可高水平完成，并在微创拔牙、镍钛根管治疗、显微根管治疗及显微根管外科、精密铸造、精密附着体修复、种植义齿修复、成人错颌畸形的正畸治疗、种植支抗辅助治疗、牙周病的系统治疗等方面具有自己的特色。
　　科室主要承担北京大学医学部医学生教学、进修医教学、和北京市住院医师规范化培训等教学任务，为北京市首批口腔专科医师培训基地。